2002年5月申请规划，经学校批准，2004年进行实地考察协商设计方案，2006年3月迁入崂山校区档案馆新址。新馆规划做了百年大计，使用面积办公350平方米、接待阅览300平方米、库房750平方米、展区500平方米，扩大了发展空间，为学校加强档案管理、提升社会形象等各方面工作打下坚实基础。

迁入新馆之后的暑假，全馆工作人员紧锣密鼓、分工合作，按照《高校档案实体分类法》将青科大全宗的大部分档案进行重新整理，实现了馆藏建校后各大类档案的统一化管理，同时复制卷内目录，为实现档案文件级数字化管理创造条件。

2006年上半年考察购置网络版档案管理软件，并积极进行特色建设，将原单机版案卷级数据全部导入运行，下半年教学档案收集时开始试用。2007年上半年根据调整后的分类方法，全面实现档案网上移交，快速进入实用阶段，无论是调试速度还是利用效率均达到省属高校领先水平。2006年之后馆藏档案全部实现文件级数字化管理，同时着手推进之前案卷的文件级目录输入工作。

2004年参照《高校档案实体分类法》开始创建、试行学校全宗卷建设标准，并在管理软件中建立特色栏目，进行全面完善，规整设立全宗卷近200卷/册，制定出相应的管理办法，加强了档案业务建设，在高校中处于领先水平。

在2005年原版基础上，2007年底开始着手重新建设，2008年初开始运行，新建网站推出众多实用且具特色的栏目，搭建了一个直观、高效的网上服务平台，年度流量近10万人次，扩大了利用面，使原始档案查阅量降低，广泛提高了工作效率。由于档案工作对外宣传方面的突出表现，在2009年全国高等教育档案学术研讨会上，作为教育部提名的全国15所高校之一，我校成为山东省唯一受表扬单位。网站建设项目2010年获山东省档案信息资源开发利用成果一等奖。

2008年4月28日在全国妇联召开的“迎奥运百城千岗”表彰会上荣获“全国巾帼文明岗”荣誉称号。档案馆巾帼文明岗创建活动始自2004年，历获山东省“巾帼文明岗”、青岛市“十佳女职工建功立业标兵岗”、山东省“女职工建功立业标兵岗”等荣誉称号，这些荣誉既是压力也是动力，全馆人员为此牢记“以人为本，服务为先，爱岗敬业，乐于奉献”的服务宗旨，坚持“一张笑脸、一声问候、一颗诚心、一份责任、一语相送”的“五个一”服务规范，团结协作、扎实勤恳地完成各项工作任务，以实际行动践行着共产党员的誓言。

2009年8月《年鉴》进行了全新改版，一、二级栏目结构进行了归纳调整，目录更加流畅美观，逻辑性增强，查阅方便；内容相应地进行了增删整合，在突出特色、专题的同时，保留、增加了利用率高的内容，扩大了服务功能；丰富了记载形式，增加了彩页、页眉，申请了准印证，提高了印刷质量。改版后的《年鉴》得到了各级领导和职能部门的充分肯定，在日常管理工作中起到了参谋和助手作用，特别是通过网站在校园网上载了大量的编研信息，更将这个作用发挥到极致。十一五期间《年鉴》连续5年获得山东省档案信息资源开发利用成果二等奖，分别获得山东省第二届、第三届优秀年鉴二等奖。

2009年11月26日，山东省委组织部干部档案目标管理工作检查团代中组部，对学校干部人事档案目标管理工作进行检查验收，认为：青岛科技大学的干部人事档案目标管理工作起步较早，领导重视、设施完备、制度健全、基础扎实。干部档案借（查）手续规范，材料收集齐全、信息审核细致、分类准确。档案整理标准很高、质量很高、加工很到位，成绩显著，一次通过干部人事档案目标管理验收考核，达到一级标准，待报中组部批准。将建校来所有教职员工的个人档案按照现行标准征集补充、整理装订，并同时确认“三龄一历”、将个人相关信息录入数据库，期间工作人员做了大量细致的工作。

2010年6月，接受了山东省档案局和教育厅进行的高校检查，专家组通过听汇报、看材料，对库房、案卷、设施等情况进行实地查看，与档案工作人员座谈交流等形式，对各项指标进行纪实评价和量化打分，认为：领导重视，分工明确；档案管理机构及各项管理制度健全，落实到位；档案门类及检索工具齐全，编研工作成绩显著，学术论文水平高、数量多。8月学校获得全省高校档案工作优秀单位称号，这是自2000年学校获山东省教育委员会“高等学校档案目标管理”省一级奖牌之后，再一次接受全省档案工作检查。

2010年是学校校庆60周年，档案馆承担了校史馆更新任务，利用假期加班查阅、整理和征集材料，最终如期开馆。此次更新按照学校发展历史阶段为主线，同时突出重点和特色主题的设计思路，采取挖掘馆藏和重点收集相结合的办法，补充更新照片720余张；图表全部更新；将100多张展板重新进行整合，对展区也进行了局部改造。更新后的校史馆，在校庆期间得到各级领导、校友和师生员工的普遍好评。被认定为青岛市“全市未成年人社会课堂”，成为学校校园文化的重要组成部分。